糖尿病、胃腸道疾病、肝病、腎炎和心臟病等都可以引起口臭。大多數糖尿病患者都伴有不同程度的免疫功能障礙，口腔中的致病菌增多，因此引起牙齦炎和牙周炎，產生難聞的氣味。加之糖尿病患者存在內分泌功能紊亂，體液中酮體的增多，酮體隨分泌的唾液和呼吸通過口腔，也會產生口臭，早晨口臭比較明顯。
胃病患者的口臭一般是由於胃蠕動異常，胃內食物消化不良，反流到食管引起口臭。胃病性口臭比較明顯，呈酸臭味。慢性胃炎、胃潰瘍病人都可出現口臭。一旦口腔中出現胃中反流的食物酸味，則說明有胃炎和食管炎存在，需要服藥治療。
肝病患者的口臭一般呈腐臭味。這是因為肝病患者的肝功能異常，導致血液中的尿素氮和氨含量增多，而氨經過呼吸從口鼻排出一部分。肝病患者出現明顯的口臭往往是肝病加重的表現，需要及時診治。一旦因肝病出現肝昏迷，同時伴有口腔出血和明顯的口臭，說明肝功能衰竭，患者生命即將走到盡頭。
腎炎患者出現腎功能異常時，會產生較明顯的口臭。患者常常感覺口中有臭咸菜的味道，而其他人則可嗅到臊臭味。
心臟病患者的口腔異味一般為輕度腐爛臭味，自己也能感到口腔內有異味，而且刷牙和漱口無明顯效果。心臟病引起的口臭多是口腔內菌群發生變化所致。另外，許多治療心臟病的藥物也會抑制唾液的分泌，使口腔中的細菌增多，導致口臭。
專家提醒，口腔局部疾病引起的口臭，經過治療可以收到比較好的療效。全身性疾病引起的口臭，單純依靠口腔局部治療沒有明顯效果，需要配合全身疾病的治療才能顯效。
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